MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010158	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010158	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010158	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010158	T	6	6	2015	2020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010158	CAG	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010158	ACA	2	6	2116	2121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010158	A	6	6	2132	2137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010158	AC	3	6	2211	2216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010158	GAT	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010158	T	6	6	2373	2378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010158	GTT	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010158	T	6	6	2385	2390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010158	GTC	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010158	GACGG	2	10	2503	2512	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010158	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010158	TGT	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010158	TCAG	2	8	2544	2551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010158	ACAG	2	8	2559	2566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010158	AACA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010158	ACA	3	9	2933	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010158	CGA	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010158	GGC	2	6	3026	3031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010158	TG	3	6	3034	3039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010158	GAA	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010158	GCG	2	6	3408	3413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010158	CTCA	2	8	3425	3432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010158	CA	3	6	3453	3458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010158	A	6	6	3492	3497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010158	C	6	6	3548	3553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_010158	C	6	6	3629	3634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_010158	TG	3	6	3782	3787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010158	C	6	6	3794	3799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_010158	GCA	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010158	TTGAAG	2	12	3925	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010158	T	6	6	4061	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010158	GCA	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010158	A	7	7	4094	4100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010158	AAG	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010158	CAG	2	6	4155	4160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010158	ATG	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010158	TGC	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010158	TGTA	2	8	4218	4225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010158	T	8	8	4264	4271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010158	ATT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010158	ATTT	2	8	4322	4329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010158	ATT	2	6	4794	4799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010158	A	7	7	5910	5916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010158	A	7	7	5926	5932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010158	GAC	2	6	6545	6550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010158	ATT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010158	ATT	2	6	6588	6593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010158	ATA	2	6	6622	6627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010158	AG	3	6	6643	6648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010158	TC	3	6	7617	7622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010158	TCC	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010158	GGA	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010158	AGG	2	6	7660	7665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010158	TG	3	6	7689	7694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010158	TGT	2	6	7735	7740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010158	CAC	2	6	8534	8539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010158	ACAG	2	8	8567	8574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010158	CAA	2	6	8585	8590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010158	CCG	2	6	8604	8609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010158	ACGA	2	8	8664	8671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010158	TGCC	2	8	8674	8681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010158	T	6	6	8702	8707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010158	TGG	2	6	8715	8720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010158	CAA	2	6	8799	8804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010158	TCAGAC	2	12	8847	8858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010158	TGC	2	6	9070	9075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010158	A	8	8	9076	9083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010158	AAT	2	6	9187	9192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010158	ACAA	2	8	9204	9211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010158	T	6	6	9218	9223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010158	T	7	7	9231	9237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010158	TGG	2	6	11521	11526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010158	CGT	2	6	11552	11557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010158	TGA	2	6	11566	11571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010158	T	6	6	11623	11628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010158	CAG	2	6	11704	11709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010158	ACA	2	6	11724	11729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010158	A	6	6	11740	11745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010158	AC	3	6	11819	11824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010158	GAT	2	6	11849	11854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010158	T	6	6	11981	11986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010158	GTT	2	6	11989	11994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010158	T	6	6	11993	11998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010158	GTC	2	6	12007	12012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010158	GACGG	2	10	12111	12120	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010158	A	6	6	12134	12139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010158	TGT	2	6	12144	12149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010158	TCAG	2	8	12152	12159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010158	ACAG	2	8	12167	12174	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010158	AACA	2	8	12536	12543	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010158	ACA	3	9	12541	12549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010158	CGA	2	6	12625	12630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010158	GGC	2	6	12634	12639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010158	TG	3	6	12642	12647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010158	GAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010158	GCG	2	6	13016	13021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010158	CTCA	2	8	13033	13040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010158	CA	3	6	13061	13066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010158	A	6	6	13100	13105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010158	C	6	6	13156	13161	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_010158	C	6	6	13237	13242	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_010158	TG	3	6	13390	13395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010158	C	6	6	13402	13407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_010158	GCA	2	6	13486	13491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010158	TTGAAG	2	12	13533	13544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010158	T	6	6	13669	13674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010158	GCA	2	6	13684	13689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010158	A	7	7	13702	13708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010158	AAG	2	6	13716	13721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010158	CAG	2	6	13763	13768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010158	ATG	2	6	13775	13780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010158	TGC	2	6	13796	13801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010158	TGTA	2	8	13826	13833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010158	T	8	8	13872	13879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010158	ATT	2	6	13917	13922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010158	ATTT	2	8	13930	13937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010158	ATT	2	6	14402	14407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010158	A	7	7	15518	15524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010158	A	7	7	15534	15540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010158	GAC	2	6	16153	16158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010158	ATT	2	6	16175	16180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010158	ATT	2	6	16196	16201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010158	ATA	2	6	16230	16235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010158	AG	3	6	16251	16256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010158	TC	3	6	17225	17230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010158	TCC	2	6	17237	17242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010158	GGA	2	6	17251	17256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010158	AGG	2	6	17268	17273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010158	TG	3	6	17297	17302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010158	TGT	2	6	17343	17348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010158	CAC	2	6	18142	18147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_010158	ACAG	2	8	18175	18182	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010158	CAA	2	6	18193	18198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010158	CCG	2	6	18212	18217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_010158	ACGA	2	8	18272	18279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010158	TGCC	2	8	18282	18289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010158	T	6	6	18310	18315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010158	TGG	2	6	18323	18328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010158	CAA	2	6	18407	18412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010158	TCAGAC	2	12	18455	18466	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010158	TGC	2	6	18678	18683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010158	A	8	8	18684	18691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010158	AAT	2	6	18795	18800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010158	ACAA	2	8	18812	18819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010158	T	6	6	18826	18831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010158	T	7	7	18839	18845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010158	TGG	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010158	CGT	2	6	21160	21165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010158	CG	3	6	21184	21189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_010158	AT	3	6	22987	22992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010158	TACT	2	8	22996	23003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_010158	TTGC	2	8	24928	24935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_010158	GCG	2	6	25198	25203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_010158	CCA	2	6	25273	25278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_010158	T	6	6	25390	25395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_010158	CTG	2	6	30017	30022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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187	NC_010158	GTT	2	6	30155	30160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_010158	TA	3	6	46694	46699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_010158	T	6	6	46841	46846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_010158	TGG	2	6	46977	46982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_010158	GAA	2	6	47054	47059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_010158	GAC	2	6	47105	47110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_010158	GGC	2	6	47116	47121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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304	NC_010158	CAT	2	6	47302	47307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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319	NC_010158	TAT	2	6	65447	65452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_010158	GAA	2	6	96445	96450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_010158	CAC	2	6	96489	96494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_010158	GATA	2	8	96537	96544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NC_010158	GCAA	2	8	96638	96645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
443	NC_010158	CCT	2	6	96668	96673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_010158	CAGG	2	8	96689	96696	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
445	NC_010158	GCT	2	6	96938	96943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_010158	TGGC	2	8	96966	96973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
447	NC_010158	GCG	2	6	96978	96983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_010158	AACAA	2	10	97035	97044	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
449	NC_010158	GCT	2	6	97062	97067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_010158	TC	3	6	97094	97099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
451	NC_010158	GTT	2	6	97102	97107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_010158	CAT	2	6	97287	97292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_010158	CAT	2	6	97512	97517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_010158	ATT	2	6	97519	97524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_010158	ATG	2	6	97528	97533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_010158	ATT	2	6	97554	97559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_010158	TAA	2	6	99372	99377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_010158	GCA	2	6	99389	99394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_010158	CATA	2	8	100247	100254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
471	NC_010158	TA	3	6	100311	100316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_010158	A	6	6	100391	100396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_010158	T	7	7	100413	100419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_010158	GTC	2	6	100467	100472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_010158	GGA	2	6	100637	100642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
477	NC_010158	ATG	2	6	101908	101913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_010158	TTG	2	6	103376	103381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
481	NC_010158	CAA	2	6	103382	103387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_010158	ACC	2	6	103438	103443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
483	NC_010158	ATG	2	6	103502	103507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
484	NC_010158	AAT	2	6	103521	103526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_010158	TGT	2	6	103546	103551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
486	NC_010158	T	6	6	103555	103560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_010158	GT	3	6	103561	103566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_010158	TAA	2	6	105167	105172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_010158	GAT	2	6	105201	105206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_010158	GAAA	2	8	105335	105342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_010158	TC	4	8	105344	105351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_010158	GCA	2	6	105381	105386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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